1.如果储存状态的纯水是不循环的，则应使存水量少以减少水质下降和细菌滋长。

　　2.如果要保持纯水较低的微生物含量，必须使纯水经过包括纯化手段（如离子交换柱、UV灯）和储水箱在内的循环通路，并保持循环。储水箱应密封并配备滤菌器或呼吸口空气滤器以防止空气中污染物进入水箱。

　　3.为防止湿管道内生物污染膜的形成应进行定期消毒。可以使用释放氯的药片、过氧醋酸或过氧化氢进行消毒处理。

　　4.为抑制藻类生长，应避免使用半透明的水箱和管路，并避免将储水箱安装在阳光直射或靠近热源的位置。

　　5.很多以自来水进水的反渗透系统的额定工作压力是60 psi(4 bar)，如果进水压力过低，RO产成水的流速和水的纯度将会降低。

　　6.定期更换离子交换柱，通常大约每6个月更换一次，这样可以使细菌污染降到低。

　　7.系统断电停止运行一段时间，比如周末后，至少应把5升纯水排掉再接水，特别是进行高灵敏度实验时。

　　8.为确保电阻率监测器的灵敏度，应该由有资质的工程师每12个月清洗一次传感器的电极。

　　9.如果饮用水进水口开放，不要关闭反渗透系统的产成水或浓水出口。如果产成水出口受阻，会出现反压并可能导致反渗透膜破裂，这会引起膜失效。同样，在正常工作时浓水出口也应该保持通畅，否则容易造成沉淀和污垢淤积在膜表面。

　　10.为延长反渗透膜的寿命，要确保定期冲洗和清洁，冲洗可以从膜表面冲洗掉颗粒物和沉淀物。

　　11.对灵敏度很高的分析技术来说，取样容器应在使用前用超纯水冲洗。当有机物的含量要求很高时，建议使用玻璃容器；这也可能需要特殊预处理。